Длина карапакса самцов египетской черепахи достигает 10 см, у самок 13 см.
 Подобные размеры делают данную черепаху самой маленькой сухопутной черепахой в мире. Карапакс египетской черепахи окрашен в желтовато-песочные тона с желто-бурой каймой по краям пластин. Животное внешне похоже на средиземноморских черепах.
Самцы отличаются от самок вогнутым пластроном, и более длинным хвостом. У самок пластрон ровный.